Gottsunda Centrum ägs och förvaltas av Uppsala Kommuns Fastighets AB, som är Uppsala kommuns bolag som förvärvar,utvecklar och förvaltar stadsdels- och närcentrum och därmed bidrar till kommunens hållbara utveckling och tillväxt. Förutom Gottsunda Centrum äger och förvaltar bolaget även kvarteret Flöjten samt Storvreta centrum, som tillsammans lockar närmare 3 miljoner besökare per år. Den totala uthyrbara ytan är 65 000 kvm och i de lägenheter som förvaltas av Uppsala Kommuns Fastighets AB bor ca 550 personer.